Sea Shepherd wurde 1977 von Kapitän Paul Watson gegründet. Seitdem ist sie zu einer weltweiten Bewegung mit unabhängigen nationalen und regionalen Einheiten in über 20 Ländern herangewachsen. Diese Gruppen sind durch eine gemeinsame Mission durch die 2013 gegründete Sea Shepherd Global mit Sitz in Amsterdam vereint, die Finanzen, Kommunikation, Logistik und eine Flotte von fünf Schiffen koordiniert, um bei direkten Meeresschutzkampagnen auf der ganzen Welt zusammenzuarbeiten. Sea Shepherd Global ist eine in den Niederlanden als "Stichting Sea Shepherd Global" eingetragene gemeinnützige Organisation unter der Leitung von CEO Captain Alex Cornelissen. Sea Shepherd Global agiert - sowohl finanziell als auch rechtlich - unabhängig von der in den USA ansässigen Sea Shepherd Conservation Society (SSCS).